Благовещенский Ионо-Яшезерский монастырь был возвращён Петрозаводской и Карельской епархии Русской Православной Церкви в конце 2019 г. В мае 2020 г. в самый разгар пандемии в обители начались работы по консервации сохранившихся построек монастыря.

После ста лет разрухи и опустошения все деревянные постройки в монастыре были уничтожены, братии предстоит спасать уцелевшие каменные здания, которые пришли в полный упадок. В числе переданных объектов – храм Преображения Господня, построенный над местом погребения основателя монастыря преподобного Ионы, Святые и Озерные врата, а также каменная ограда из малинового кварцита с кирпичными угловыми башнями.

Было решено начать работы с Преображенского храма. По согласованию с департаментом по охране объектов культурного наследия Республики Карелия в храме были установлены подпорные конструкции, удерживающие арки. Продолжались работы по расчистке территории монастыря от мусора, битого камня и кустарника.

В 2021 г. по благословению митрополита Петрозаводского и Карельского Константина монастырь стал участником второго конкурса Президентских грантов с проектом «Ковчег преподобного Ионы». В проект вошли работы по продолжению аварийно-спасательных и консервационных мероприятий в Преображенском храме монастыря.

Усилиями братии, волонтёров и трудников проект активно реализовывался с 2022 г. и завершен в ноябре 2023 г. По благословению правящего архиерея Яшезерский монастырь совместно с департаментом по охране объектов культурного наследия Республики Карелия участвовал в подаче заявок на проведение работ по консервации всего монастырского комплекса. Это позволило обители войти в федеральную программу по сохранению объектов культурного наследия Республики Карелия.

Проект по консервации комплекса зданий Благовещенского Ионо-Яшезерского монастыря разработан фирмой ООО «Межрегиональные проекты и программы развития». Реализация проекта осуществлялась строительной фирмой и успешно завершена в конце октября 2023 г. Следующий этап работы намечен на декабрь текущего года. Планируется провести работы по установке двух пирсов для доставки строительных материалов и грузов в монастырь по озеру